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摘要癌癥全基因組和轉錄組測序(cWGTS)在腫瘤學中的效用日益得到認可。然而，由于需要在臨床相關的時間范圍內提供結果，以及對檢測靈敏度、報告和結果優先級的關注，實施cWGTS面臨挑戰。在一項前瞻性研究中，我們開發了一個工作流程，在9天內報告全面的cWGTS結果。將cWGTS與診斷組分析進行比較，證明了cWGTS在單一工作流程中以相當的靈敏度捕獲所有臨床報告突變的潛力?；鶞蕼y試確定臨床WGS測... 摘要雖然使用DNA條形碼對樣品進行多路復用徹底改變了生物醫學發現的步伐，但基于實時成像的應用的多路復用受到了熒光蛋白數量的限制，這些熒光蛋白可以使用普通顯微鏡設備進行解卷積。為了解決這一限制，我們開發了可視條形碼，通過靶向特定亞細胞位置的不同熒光蛋白來區分單細胞的克隆身份。我們證明了這些條形碼的去卷積是高度準確的，并且對許多細胞擾動是魯棒的。然后，我們使用可視條形碼，通過將不同活報告子的12... 摘要癌蛋白SS18-SSX是滑膜肉瘤的標志。然而，作為SS18-SSX融合蛋白的一部分，SS18的功能仍不清楚。這里，我們描述了人類SS18/BRG1和酵母SNF11/SNF2亞復合物的結構。這兩個亞復合物組裝成具有相似構象的異二聚體，表明SNF11可能是SS18在染色質重塑復合物中的同源物。重要的是，我們的研究表明，固有無序區QPGY結構域的自締合導致SS18或SS18-SSX的液-液相分... 摘要RNA結合蛋白在分泌途徑中的生物學作用尚未完全確定。在這里，我們描述了人類HDLBP/Vigilin直接與超過80%的ER定位mRNAs相互作用。PAR-CLIP分析顯示，這些轉錄物代表高親和力的HDLBP底物，并特異性結合于其編碼序列(CDS ),與CDS/3’UTR結合的胞質mRNAs相反。HDLBP與長的富含銅的基序強烈交聯，這些基序經常位于ER定位的mRNAs的CDS中，并導致高... 摘要擴散的癌細胞經常寄居在次級器官的脈管系統附近。然而，我們對血管周圍部位引起的細胞串擾的理解仍然是初步的。在這里，我們確定了在乳腺癌肺部定植期間，控制促轉移血管小生境形成的細胞間機制。我們發現，在轉移相關內皮細胞(ECs)中誘導的特定分泌因子通過增強干細胞特性和癌細胞的生存力來促進小鼠的轉移。通過tenascin C (TNC)刺激Toll樣受體4 (TLR4)激活的血管周巨噬細胞，通過分... 摘要對缺氧和難治性實體腫瘤的有限治療效果阻礙了光動力療法的實際應用。在此，我們報告了我們對鋨-過氧化物絡合物(Os2)，它在黑暗中不活躍，但能釋放一個過氧配體O2??即使在沒有氧氣的情況下，在光照射下也會轉化成細胞毒性鋨絡合物(Os1). Os1在低氧腫瘤中存在或不存在輻射時具有細胞毒性，表現為化療藥物。同時，光激活的Os2誘導活癌細胞內源性1，4-二氫煙酰胺腺嘌呤二核苷酸光催化氧化，導致鐵... 摘要用雄激素受體途徑抑制劑(ARPIs)治療前列腺癌導致出現耐藥性腫瘤，其特征是譜系可塑性和向神經內分泌譜系的分化。在這里，我們發現ARPIs誘導了由大規模染色質重塑介導的快速表觀遺傳改變，以支持干細胞/神經元轉錄程序的激活。我們發現前神經元轉錄因子ASCL1基序富含在超可及區域。ASCL1作為譜系可塑性神經元轉錄程序的驅動因子，支持治療抗性和神經內分泌表型。靶向ASCL1將神經內分泌譜系切... 摘要染色體易位產生的致癌融合蛋白在癌癥中起主要作用。其中，EWSR1和轉錄因子之間的融合產生具有強大染色質調節活性的癌基因，能夠在許可的前體細胞中建立復雜的基因表達程序。在這里，我們定義了透明細胞肉瘤的表觀遺傳學和三維連接景觀EWSR1-ATF1融合基因。我們發現EWSR1-ATF1表現出獨特的DNA結合模式，需要EWSR1結構域并促進ATF1重定位到新的遠端位點，導致染色質活化和控制原發性... 摘要最近在細胞系和有限數量的原發性腫瘤中提出了由關鍵轉錄調節因子的表達定義的小細胞肺癌(SCLC)的分子亞型。轉移性小細胞肺癌中神經內分泌(ne)亞型的臨床和生物學意義，以及它們在患者腫瘤內部和之間以及在患者衍生模型中的變化程度尚不清楚。我們綜合了一系列轉移部位的小細胞肺癌的組織學、轉錄組、外顯子組和治療結果，揭示了腫瘤內和腫瘤間NE分化的復雜異質性。轉錄組分析證實了先前描述的亞型，基于AS... 摘要AKT是PI-3K信號通路的關鍵分子調節因子，在不同的實體癌類型中發生體細胞突變，異常的AKT激活促進癌細胞生長、存活和代謝的改變1,2,3,4,5,6,7,8。最常見的akita television 秋田電視突變(AKT1E17K)使受影響的實體腫瘤對AKT抑制劑療法敏感7,8。然而，我們對AKT中潛在激活突變的長尾的通路依賴性和抑制劑敏感性知之甚少，這限制了我們在預期特征的癌癥患者... 免疫熒光方法中的重要環節1、冰凍切片制備：建議用新鮮組織，否則組織細胞內部結構破壞，易使抗原彌散。選用干凈鋒利的刀片、組織一定要冷凍適度等，防止裂片和脫片嚴重。2、組織切片固定：切好片風干后立即用冰丙酮等固定液進行固定5-10min，尤其要... 免疫組化成功的經驗和失敗的教訓匯總1. 石蠟切片在染色過程中出現脫片現象？一般來說，如果用多聚賴氨酸包被過的片子做正常免疫組織化學染色的話是不會掉片子的。但如果要做抗原修復的話，如果片子處理不好的話是有可能掉片子的。你可以試試一下的方法：a... 免疫組化技術常見問題：1、石蠟切片和冰凍切片的比較？2、一抗和二抗的選擇要點和技巧是什么？3、在什么情況下使用Triton-X100？4、封閉血清的選擇原則是什么？5、抗體孵育條件的比較？6、一抗4度孵育后為什么要進行37度復溫？7、DAB... 臨床常用免疫組化指標的意義臨床病理工作中，我們常用到“腫瘤細胞免疫組化耐藥預后標記”，但是許多單位只寫陽性結果，不寫臨床意義，其結果對臨床幫助不大，因為許多醫生不懂得這些結果的意義，因此建議大家在出此類報告時，把“腫瘤細胞免疫組化耐藥預后標... 中國藥典細菌內毒素檢查法學習與討論本法系利用從鱟的變形細胞中提取的試劑來檢測或量化由革蘭陰性菌產生的細菌內毒素，以判斷供試品中細菌內毒素的含量是否符合規定的一種方法。細菌內毒素檢查包括兩種方法，即凝膠法和光度測定法，后者包括濁度法和顯色基質... 細菌內毒素檢查法研究進展細菌內毒素試驗（簡稱“鱟試驗）。自1973年以來，鱟試驗被證明是一種有效檢測細菌內毒素（熱原）存在的試劑。于是1973年美國食品與藥品管理署（FDA）就推薦鱟試驗用于生產工藝流程的內毒素質量控制。因為這種鱟試驗的靈敏... 免疫沉淀（IP）的常見問題及解答1. 用于一般免染的抗體是否都可以用作免疫沉淀實驗？ 答：抗體的性質對免疫沉淀實驗影響很大?？贵w不同，和抗原以及Protein G或Protein A的結合能力也就不同。所以一般免染能結合的抗體未必能用于IP... |
